Qu'est-ce que l'influenza aviaire ?

L'Influenza aviaire est une infection virale hautement contagieuse des oiseaux sauvages et d’élevage. Les périodes et mouvements de migration des oiseaux sauvages ont un impact sur le niveau de risque de transmission, lié à la faune sauvage, des virus influenza aux élevages de volailles. Susceptibles d'entrainer une mortalité extrêmement forte des animaux et de ce fait d'importantes pertes économiques, certains virus de l’influenza aviaire peuvent dans certaines conditions se transmettre à l'Homme. Profil d’une maladie hautement contagieuse et tour d’horizon des travaux de l’ANSES, acteur majeur pour éviter la propagation des virus hautement pathogènes d’influenza aviaire.

L’influenza aviaire est une maladie animale très contagieuse causée par des virus Influenza de type A, qui peuvent infecter de très nombreuses espèces d’oiseaux sauvages et d’élevage. Les virus de l’influenza aviaire sont classés selon les caractéristiques de deux des protéines de l’enveloppe virale (structure externe du virus) dites hémagglutinine : 16 sous-types numérotés de H1 à H16 chez les oiseaux et neuraminidase : 9 sous-types numérotés de N1 à N9 susceptibles d’être associés selon toutes les combinaisons possibles. On distingue par ailleurs deux catégories de virus selon leurs caractéristiques de virulence : les virus faiblement pathogènes (IAFP) et les virus hautement pathogènes (IAHP), ces derniers appartenant tous aux sous-types H5 ou H7.

Sous sa forme hautement pathogène, la maladie se propage très rapidement chez les oiseaux et entraîne une mortalité très élevée, induisant des pertes économiques considérables pour les filières avicoles. Certaines souches du virus peuvent également infecter certains mammifères tels que le porc, les félidés, le furet et dans certaines conditions, se transmettre à l’Homme. L’influenza aviaire est donc une maladie à potentiel zoonotique.

Les volailles d’élevage sont principalement contaminées par les oiseaux sauvages infectés ou, lors d’épizootie en élevage, par les autres élevages avicoles infectés. En effet, une grande diversité d’espèces sauvages et notamment les canards et les oies, qu’ils soient migrateurs ou non, sont susceptibles d’être infectés.

L’homme peut être contaminé par les volailles infectées qui présentent ou non des symptômes si la souche de virus présente des caractéristiques de transmission à l’Homme. De nombreux facteurs peuvent contribuer à la propagation de ces virus : la mondialisation et les échanges commerciaux internationaux, les pratiques d’élevage ou encore les déplacements migratoires des oiseaux sauvages.

Le saviez-vous ?

Les virus influenza A possèdent une grande « plasticité » et évoluent en permanence en échangeant leurs gènes ou en acquérant des mutations : autant d’évènements susceptibles de permettre à ces virus d’infecter de nouvelles espèces, de « contourner » les défenses immunitaires de l’hôte animal ou humain ou de devenir le cas échéant plus virulents.

La transmission entre oiseaux peut être directe par des contacts rapprochés entre individus - sécrétions respiratoires, matières fécales- ou indirecte par l’exposition à des matières contaminées - nourriture, eau, matériel ou vêtements contaminés. Le virus pénètre dans l’organisme des volailles par la voie respiratoire ou par la voie digestive.

Selon les modalités d’exposition et la virulence de la souche virale, la période d'incubation de la maladie peut varier de 1 à 3 jours au niveau individuel et s’étendre jusqu’à 14 jours au niveau d’un troupeau de volailles. Les symptômes chez les oiseaux sont divers : troubles nerveux (paralysie, convulsions, perte d’équilibre), troubles respiratoires, troubles digestifs, œdème de la tête, ou baisse du nombre d’œufs pondus. La maladie peut aussi être inapparente et seulement détectable par des analyses en laboratoire ou se manifester par des formes modérées : diminution de l’appétit, baisse de ponte, signes respiratoires plus ou moins discrets…

L’influenza aviaire est présente dans le monde entier avec différentes souches virales plus présentes dans certaines parties du monde. Depuis les années 1950, de nombreux épisodes plus ou moins graves liés aux virus d’influenza aviaire hautement pathogènes ont été rapportés dans le monde dans les élevages de volailles. La souche hautement pathogène A(H5N1) du virus de l’influenza aviaire a beaucoup fait parler d’elle de 1997 aux années 2010 en raison de l’apparition en Asie de foyers importants chez les oiseaux d’élevage et les oiseaux sauvages et de son potentiel zoonotique. Ces dernières années, ce sont plutôt des virus H5N6, H5N5 ou H5N8 qui sont très répandus et préoccupants en raison de leur degré de virulence et de leur large distribution non seulement chez les volailles mais également chez les oiseaux sauvages.

Il n’existe aucun traitement spécifique de la maladie. À l’heure actuelle, la vaccination des animaux est techniquement délicate. En effet, il faut garantir que le vaccin soit bien adapté aux virus présents dans la zone considérée et que la mise en œuvre du vaccin ne favorise pas la circulation inapparente du virus sauvage chez les oiseaux vaccinés. Pour les États membres de l’Union européenne, la vaccination est interdite et la lutte contre la maladie est basée sur le renforcement de la biosécurité dans les périodes à risque, pour éviter la contamination à partir des oiseaux sauvages ou la transmission entre élevages, ainsi que sur la surveillance des élevages de volailles avec comme objectif la détection précoce et l’élimination des volailles infectées ou sensibles.

La surveillance de cette maladie est réglementée au niveau international. En France, elle est classée en catégorie 1, donc à prophylaxie et déclaration obligatoires gérées par l’État. Un réseau permanent de surveillance et de diagnostic existe. Il met à contribution les éleveurs, les vétérinaires sanitaires, les techniciens d’élevage, les directions départementales en charge de la protection des populations, des agents de l’Office français de la biodiversité, les ornithologues, ainsi que les laboratoires vétérinaires de diagnostic et le Laboratoire National de Référence.

• L’ANSES, laboratoire national de référence au cœur du diagnostic

Un réseau de laboratoires vétérinaires encadrés par le laboratoire national de référence influenza aviaire (LNR) de l’ANSES basé sur le site de Ploufragan (laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort) est opérationnel en permanence pour effectuer rapidement toutes les analyses nécessaires au diagnostic. Lors de toute suspicion de la maladie, basée sur des critères officiels de suspicion clinique, des prélèvements standardisés sont effectués et immédiatement envoyés aux laboratoires vétérinaires agréés qui réalisent les tests RT-PCR de criblage. Le laboratoire de l’ANSES assure les analyses de confirmation en cas de résultat positif obtenu lors de ces tests. Le Laboratoire participe également aux essais annuels inter-laboratoires d’aptitude à l’échelon européen et organise leur équivalent au niveau français de façon à garantir le caractère opérationnel des laboratoires vétérinaires de criblage. Par ailleurs, le LNR développe de nouvelles méthodes d’analyse, dispose d’une "souchothèque" qu’il enrichit régulièrement et met en œuvre des investigations poussées visant à caractériser les souches isolées. Le Laboratoire de l’ANSES contribue également à la mise en commun au niveau international des données concernant la circulation des souches de virus de l’influenza aviaire, dans le cadre de l’OFFLU (réseau mondial conjoint de l’Organisation Mondiale de la Santé Animale et de la FAO d’expertise sur les grippes animales).

• Une activité de recherche centrée sur le canard, relais potentiel de la transmission aux autres espèces de volailles

Au cours des dernières épizooties en France (hivers 2015-2016 et 2016-2017), le laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort a conduit des travaux de recherche sur la persistance du virus dans les lisiers de canards et la mise au point d’une méthode pour sa détection dans les élevages et leur environnement. Cette dernière permettrait de détecter les zones et matériels les plus contaminés et d’évaluer l’efficacité des mesures de nettoyage et désinfection mises en œuvre, préalables à la reprise d’activité et la réintroduction d’animaux dans les élevages. Des investigations épidémiologiques ont été conduites sur le terrain dans les différents départements concernés aux côtés des directions départementales en charge de la protection des populations. Au cours de cette période, l'Agence a également contribué à l’étude de l’efficacité de vaccins contre l’influenza aviaire.

L’épizootie d’influenza aviaire hautement pathogène survenue en France au cours de l’hiver 2016-2017, a impacté très durement la filière des palmipèdes à foie gras mais également l’ensemble des filières avicoles françaises. L’étude approfondie des caractéristiques des virus influenza aviaire détectés lors de cette épizootie en termes de variabilité génétique, d’adaptation à l’hôte et de capacité de transmission apparait essentielle afin d’améliorer la réactivité et d’adapter les mesures de lutte dans l’hypothèse d’une nouvelle émergence de virus influenza aviaire hautement pathogène. Pour répondre à ces questions, le projet PREDYT financé par le fonds FRIA 2019 est en cours depuis octobre 2019 et implique trois composantes complémentaires alliant les compétences épidémiologiques et virologiques des partenaires : l’ANSES, laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort (coordinateur), l’école vétérinaire de Toulouse et l’INRAE, Unité Virologie & Immunologie Moléculaires.

Depuis décembre 2017, le laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort contribue à une étude expérimentale portant sur la circulation des virus de l’influenza aviaire faiblement pathogènes dans les troupeaux de canards prêts à gaver en France. Cette étude vise à analyser et décrire les souches de virus circulant au sein des populations de palmipèdes gras qui, du fait de leur symptomatologie fruste ou absente lorsqu'ils sont infectés par les virus de l’influenza aviaire, peuvent participer à la diffusion du virus dans les élevages. Cette étude vise également à rechercher des solutions à apporter avec l’ensemble des acteurs concernés, pour réduire les risques d’introduction et de diffusion des virus de l’influenza aviaire faiblement pathogènes en élevage.

• L’évaluation des risques d’introduction et de diffusion de l’Influenza aviaire hautement pathogène et actualités épidémiologiques de l’Influenza aviaire

En cas d’infection constatée dans des zones proches de la France, ou lors de mortalités d’oiseaux sauvages atteints d’influenza aviaire dans notre pays, l’ANSES est régulièrement saisie par le ministère en charge de l’agriculture pour évaluer le risque d’introduction et de diffusion de la maladie dans les élevages de volailles français.

Concernant le risque lié à la faune sauvage, à l’occasion de la dernière épizootie due à un virus H5N8 l’ANSES a publié deux avis (Ajustement des niveaux de risque, Evaluation des niveaux de risque) qui apportent aux autorités sanitaires des critères pour relever ou abaisser le niveau de risque de transmission de la maladie en fonction de la période de migration des oiseaux sauvages, des zones géographiques fréquentées par ces oiseaux et du nombre d’élevages de volailles dans ces zones. Ces avis sont élaborés par des groupes d’experts multidisciplinaires qui associent épidémiologistes, virologistes, ornithologues. Le ministère en charge de l’agriculture peut se baser sur ces deux avis pour adapter le risque d’introduction d’influenza aviaire en France en fonction de la situation épidémiologique au niveau mondial et en Europe. Cette situation est régulièrement actualisée par la plateforme d’épidémiosurveillance en santé animale avec la contribution du laboratoire de l’ANSES, laboratoire national de référence pour influenza aviaire.